以有机肥为主，化学肥料为辅。早施、重施基肥，适时适量追肥，加强叶面喷肥。提倡以苹果营养诊断(叶分析和土壤分析等)结果为指导进行配方施肥，不断提高土壤肥力，增加土壤微生物活性。
深圳农产品配送要求所施用的肥料不应对果园环境和果实品质产生不良影响。
允许使用的肥料种类：
一、农家肥料
包括厩厕肥、沼气肥、绿肥、作物秸秆肥、泥肥、饼肥等。除沼气肥、绿肥外，其他肥要堆沤腐熟后使用，有害元素含量不得超标。
二、商品肥料
包括有机复混肥、腐殖酸类肥、微生物肥、无机矿质肥、叶面肥等经农业部门登记允许使用的肥料。
三、其他肥料
不含有害物质的食品、鱼渣、牛羊毛废料、氨基酸残渣、骨胶废渣、家禽家畜加工废料、糖醚厂废料等有机物料制成的经农业部门登记允许使用的肥料。
四、禁止使用的肥料种类
未经无害化处理的城市垃圾或含有金属、橡胶、塑料等有害物质的垃圾；硝态氮肥和未经腐熟的人粪尿；国家明文禁止使用的肥料和未获准登记的肥料产品。
